ACOEC es una asociación plural y horizontal que se estructura y que funciona básicamente a partir de la participación altruista y convencida de las personas que forman parte de ella. Ésta es justamente una de las mayores fortalezas de la organización.

La junta directiva se reune de forma mensual para realizar el seguimiento de la organización de forma contínua y ordenada. En estas reuniones se toman las decisiones a los problemas y las diferentes situaciones que se plantean en el curso diario de la organización.

La participación de socios y socias se materializa en las reuniones  trimestrales que desde la propia Asociación se han establecido. Así cada tres meses en el centro de Salud de la Fuente de San Luis (Valencia), las personas que conforman la organización se reúnen con el fin de compartir, reflexionar y tomar las decisiones correspondientes sobre los proyectos en marcha, las nuevas propuestas que se han canalizado a la organización o sobre cualquier temática de actualidad relacionada con el trabajo que la Asociación lleva a cabo. De este modo desde la propia organización se fomenta que la participación de socios y socias tenga lugar en los diferentes procesos de toma de decisión que van aconteciéndose y en las diferentes actividades que se impulsan desde la Asociación. Al mismo tiempo esta manera de proceder asegura una correcta información de los socios y las socias sobre cualquier aspecto vinculado a la asociación.

Con esta forma de funcionamiento y participación en la Asociación también se consigue una fuerte implicación de socias y socios, algo necesario en tanto en cuanto se parte de la realidad que las personas socias son el motor de la organización. Todo ello fortalece a la propia organización y permite mantener un crecimiento institucional y la cohesión del colectivo. Actualmente ACOEC cuenta con 28 voluntarios/as activas de 65 socios/as en total, es decir, casi un 50% de los miembros de la organización realizan trabajo voluntario.

Además de estos encuentros trimestrales, ACOEC celebra anualmente su Asamblea General en la cual cada cuatro años se elige democráticamente a la Junta Directiva. Esta tiene un importante rol en la orientación general del trabajo de la Asociación y está conformada por siete personas que ocupan los cargos de presidencia, vicepresidencia, secretaría, tesorero/a y tres vocales. 

Finalmente cabe señalar que cada cuatro meses y de manera autogestionada, aquellas personas de la organización que quieren y tienen disponibilidad, participan en los viajes que se coordinan a Ecuador para realizar el seguimiento de los proyectos en marcha, compartir con la población beneficiaria los procesos y participar en los mismos en la medida que sea posible y factible.